Group Leader Clinical Bioinformatics

Über die Rolle

In einer multidisziplinären Umgebung ist das Ziel der Clinical Bioinformatics-Gruppe, die computergestützte Biologie in klinisch verwendbare Ergebnisse zu übersetzen. Der Schwerpunkt liegt auf maßgeschneiderten Analysen und der Integration hochdimensionaler molekularer Daten, von der Variantenerkennung bis zur Einzelzellsequenzierungsanalyse. Die Entwicklung robuster Analyse-Workflows und wiederverwendbarer Komponenten erfolgt in enger Zusammenarbeit mit akademischen Institutionen und Kliniken.

Aufgaben

• Projektmanagement: Strukturierung und Überwachung von Projekten von Anfang bis Ende, Gewährleistung klarer Scope-Definitionen, Meilensteinplanung, Risikomanagement und Dokumentationsstandards.
• Technische Leitung: Entwicklung und Erweiterung von Pipelines mit Nextflow und Snakemake sowie Festlegung von Standards für Workflow-Engineering und langfristige Wartbarkeit.
• Verantwortung für die Lieferung: Übernahme der Verantwortung für Zeitpläne, Qualität und Abstimmung der Stakeholder über mehrere Projekte hinweg.
• Projektakquise und Kundenmanagement: Aufbau von Beziehungen zu Forschenden, Kliniker:innen und Partnern sowie Übersetzung von Anforderungen in klare Ergebnisse.
• Clinician partnership: Enge Zusammenarbeit mit Kliniker:innen, um nützliche Informationen bereitzustellen und technische Komplexität einfach zu halten.
• Innovation und wissenschaftlicher Fortschritt: Aktives Verfolgen von Entwicklungen in der Bioinformatik und Übersetzung vielversprechender Ansätze in robuste, klinisch anwendbare Lösungen.
• Teamübergreifende Zusammenarbeit: Enge Zusammenarbeit mit Software Engineering, Systems Operations, Biostatistics sowie Screening & Lab Automation, um integrierte Lösungen zu liefern.
• Personalführung: Rekrutierung, Mentoring und Entwicklung von Teammitgliedern zur Förderung des Wissensaustausches und hoher Standards.
• Ressourcenmanagement: Planung der Kapazitäten, Priorisierung von Arbeiten sowie Mitwirkung an Budgetierung und Berichterstattung für die Gruppe.

Erwartungen

Sie werden in dieser Rolle erfolgreich sein, wenn...

• Sie es genießen, Projekte von Anfang bis Ende zu leiten und robuste, wiederverwendbare Lösungen mit klaren Ergebnissen zu liefern.
• Sie gerne interdisziplinär arbeiten und enge Kooperationen mit Kliniker:innen und funktionsübergreifenden Partnern aufbauen.
• Sie sich in einer Führungsrolle wohlfühlen und Entscheidungen hinsichtlich Priorisierungen und Qualitätskontrolle treffen können.
• Sie in der Lage sind, komplexe multimodale Daten in klare, nutzbare Entscheidungshilfen umzuwandeln, die den Bedürfnissen der Ärzte entsprechen.
• Sie hohe Standards im Workflow-Engineering, Testing, Dokumentation und Git-basierter Zusammenarbeit setzten und ein Team dorthin führen möchten.

Profil

Nicht verhandelbar:

• Nachgewiesene Führungserfahrung in der klinischen Bioinformatik, Genomik oder translationaler Forschung.
• Praktische Erfahrung in der Entwicklung und Erweiterung von Analyse-Pipelines und wiederverwendbaren Komponenten.
• Workflow-Management mit Nextflow und/oder Snakemake und die Fähigkeit, Teamstandards festzulegen.
• Erfahrung mit Git-Versionierung als tägliche Praxis ist ein Muss.
• Starke Kommunikationsfähigkeiten mit Kliniker:innen und im Stakeholder-Management.
• Ausgezeichnete Kommunikationsfähigkeiten in Englisch.

Stark erwartet:

• Solide Programmierkenntnisse in Python oder R sowie starke Gewohnheiten in Bezug auf Code-Qualität.
• Erfahrungen mit verschiedenen Datentypen, von Variantenerkennung bis zu Einzelzellsequenzierungsanalysen.
• Erfahrung mit Qualitätskontrolle und Berichterstattung in der Genomik/Transkriptomik.

Vorteilhaft:

• Erfahrung mit Statistik oder Software-Engineering-Praktiken über Skripting hinaus.
• Nutzung von HPC und Bash.
• Kenntnisse der deutschen Sprache.

Unser Angebot

• Wertschätzung von Wissensaustausch und Teamarbeit.
• Flache Hierarchien und eine positive Grundeinstellung mit flexiblen Arbeitszeiten.
• Familienfreundliche Arbeitsmodelle und Weiterbildungsmöglichkeiten.
• Ein breites und spannendes Arbeitsfeld an der Front der transnationalen Forschung.

Über uns

ETH Zürich zählt zu den weltweit führenden Universitäten im Bereich Wissenschaft und Technik. Wir sind bekannt für exzellente Ausbildung, bahnbrechende Grundlagenforschung und den direkten Transfer neuer Erkenntnisse in die Gesellschaft.